Quatorze urnas eletrônicas apresentaram problemas e tiveram que ser substituídas em Blumenau, conforme a Justiça Eleitoral. Em todos os casos, uma segunda urna eletrônica foi instalada e a votação ocorreu sem problemas. Não foi necessário recorrer à votação em cédulas de papel.
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Os problemas apresentados foram diversos, em maioria com defeitos no hardware do equipamento. Entre os locais em que precisarem ser trocadas as urnas estão a Sulfabril (Vorstadt), EEB Vidal Ramos (Progresso), EBM Felipe Schmidt (Itoupavazinha), EEB Victor Hering (Vila Nova) e EBM Lauro Müller (Badenfurt).