É daqui a maior universidade privada de Santa Catarina, a Univali, que tem cerca de 25 mil alunos – 12 mil só no campus de Itajaí. Além da estrutura física, que abrange também as cidades de Balneário Camboriú, Biguaçu, Florianópolis, Balneário Piçarras, São José e Tijucas, a Univali tem 34 dos mais de 50 cursos de graduação entre os melhores do país, conforme edição mais recente do Guia do Estudante Profissões. Onze graduações aparecem ainda com nota quatro, em uma escala que vai até cinco, na avaliação do Exame Nacional de Desempenho de Estudantes (Enade), do governo federal.
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Para o futuro, a perspectiva é de mais crescimento e investimentos com a lei que regulamenta o funcionamento das universidades comunitárias. Sancionado pela presidente Dilma Rousseff em novembro de 2013, o texto permite, entre outras medidas, a participação de universidades como a Univali na destinação de recursos orçamentários e em editais reservados para instituições públicas, diferenciando-as de instituições privadas com fins lucrativos.
A educação profissional também se destaca em Itajaí. Em fevereiro deste ano o Senai inaugurou por aqui o primeiro Instituto de Tecnologia em Logística do país, que atende empresas de todo o Estado em um segmento cada vez mais estratégico no desempenho da indústria catarinense.